1.進(jìn)樣區(qū)帶越小越好：無論采用何種進(jìn)樣方式，毛細(xì)管插入樣品溶液的深度一般要少于毛細(xì)管總長度的1%～2%，以盡量減少樣品溶液經(jīng)毛細(xì)吸附進(jìn)入毛細(xì)管而影響進(jìn)樣量的性。樣品管中溶液少為5μL，進(jìn)樣體積為1～50nL。

　　2.進(jìn)樣時(shí)間以短為宜：通常進(jìn)樣時(shí)間為0.5～1s，此時(shí)毛細(xì)管粘附的樣品量相對于吸入的體積可忽略不計(jì)。雖然毛細(xì)管電泳的進(jìn)樣時(shí)間可至±0.1s，但由于毛細(xì)管插入樣品管時(shí)不可避免地會粘附一些溶液，進(jìn)樣時(shí)間過短會影響分析的重復(fù)性。

　　3.樣品預(yù)濃縮：受毛細(xì)管內(nèi)總體積的制約，對于濃度很稀的樣品，毛細(xì)管電泳不能象HPLC那樣可加大進(jìn)樣量來提高檢測靈敏度，但可采取一些措施來改善。

　　毛細(xì)管電泳儀峰面積重現(xiàn)性的因素及解決辦法：

　　1.溫度變化。

　　原因與結(jié)果：改變粘度和進(jìn)樣量。

　　解決辦法：毛細(xì)管恒溫。

　　2.樣品蒸發(fā)。

　　原因與結(jié)果：增加樣品濃度。

　　解決辦法：加蓋和冷卻自動進(jìn)樣器。

　　3.樣品過載。

　　原因與結(jié)果：額外進(jìn)樣。

　　解決辦法：使用進(jìn)樣端平滑的毛細(xì)管。

　　4.毛細(xì)管插入樣品引起零進(jìn)樣。

　　原因與結(jié)果：額外進(jìn)樣。

　　解決辦法：不能消除，但能量化。

　　5.毛細(xì)管電泳儀分壁吸附樣品。

　　原因與結(jié)果：峰形畸變無樣品流出。

　　解決辦法：改變緩沖液pH值，增加濃度，使用添加劑。

　　6.信噪比低。

　　原因與結(jié)果：積分誤差。

　　解決辦法：優(yōu)化積分參數(shù)，增加樣品濃度，用峰高測定。

　　7.電動進(jìn)樣。

　　原因與結(jié)果：樣品基質(zhì)不同。

　　解決辦法：采用壓力進(jìn)樣。